[ aria ]
[ bianca ]
[ Pakiet źródłowy: ariba ]
Pakiet: ariba (2.14.6+ds-5 i inne)
Odnośniki dla ariba
Pobieranie pakietu źródłowego ariba:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
Antibiotic Resistance Identification By Assembly
ARIBA is a tool that identifies antibiotic resistance genes by running local assemblies. The input is a FASTA file of reference genes and paired sequencing reads. ARIBA reports which of the reference genes were found, plus detailed information on the quality of the assemblies and any variants between the sequencing reads and the reference genes.
Inne pakiety związane z ariba
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: fastaq
- Pakiet niedostępny
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
-
- dep: libfml0 (>= 0.1)
- Pakiet niedostępny
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC support library
-
- dep: libminimap0 (>= 0.2)
- Pakiet niedostępny
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: mash
- Pakiet niedostępny
-
- dep: mummer
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-biopython
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-bs4
- error-tolerant HTML parser for Python 3
-
- dep: python3-dendropy
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-pymummer
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-pysam
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-tk
- Tkinter - Writing Tk applications with Python 3.x
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- sug: spades
- Pakiet niedostępny
Pobieranie ariba
| Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.14.6+ds-5+b1 | 1 909,9 KiB | 20 451,0 KiB | [lista plików] |
| arm64 | 2.14.6+ds-5+b1 | 1 906,2 KiB | 20 531,0 KiB | [lista plików] |