[ aria ]
[ bianca ]
[ Zdroj: ariba ]
Balík: ariba (2.14.6+ds-5 a iné)
Odkazy pre ariba
Stiahnuť zdrojový balík ariba:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
Antibiotic Resistance Identification By Assembly
ARIBA is a tool that identifies antibiotic resistance genes by running local assemblies. The input is a FASTA file of reference genes and paired sequencing reads. ARIBA reports which of the reference genes were found, plus detailed information on the quality of the assemblies and any variants between the sequencing reads and the reference genes.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom ariba
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: fastaq
- Balík nie je dostupný
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
-
- dep: libfml0 (>= 0.1)
- Balík nie je dostupný
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC support library
-
- dep: libminimap0 (>= 0.2)
- Balík nie je dostupný
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: mash
- Balík nie je dostupný
-
- dep: mummer
- Balík nie je dostupný
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-biopython
- Balík nie je dostupný
-
- dep: python3-bs4
- error-tolerant HTML parser for Python 3
-
- dep: python3-dendropy
- Balík nie je dostupný
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-pymummer
- Balík nie je dostupný
-
- dep: python3-pysam
- Balík nie je dostupný
-
- dep: python3-tk
- Tkinter - Writing Tk applications with Python 3.x
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- sug: spades
- Balík nie je dostupný
Stiahnuť ariba
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.14.6+ds-5+b1 | 1,909.9 kB | 20,451.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 2.14.6+ds-5+b1 | 1,906.2 kB | 20,531.0 kB | [zoznam súborov] |