[ aria ]
[ bianca ]
[ Източник: ariba ]
Пакет: ariba (2.14.6+ds-5 и други)
Връзки за ariba
Изтегляне на пакет-източник ariba.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
Antibiotic Resistance Identification By Assembly
ARIBA is a tool that identifies antibiotic resistance genes by running local assemblies. The input is a FASTA file of reference genes and paired sequencing reads. ARIBA reports which of the reference genes were found, plus detailed information on the quality of the assemblies and any variants between the sequencing reads and the reference genes.
Други пакети, свързани с ariba
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: fastaq
- Пакетът не е наличен
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
-
- dep: libfml0 (>= 0.1)
- Пакетът не е наличен
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC support library
-
- dep: libminimap0 (>= 0.2)
- Пакетът не е наличен
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: mash
- Пакетът не е наличен
-
- dep: mummer
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-biopython
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-bs4
- error-tolerant HTML parser for Python 3
-
- dep: python3-dendropy
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-pymummer
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-pysam
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-tk
- Tkinter - Writing Tk applications with Python 3.x
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- sug: spades
- Пакетът не е наличен
Изтегляне на ariba
| Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.14.6+ds-5+b1 | 1 909,9 кБ | 20 451,0 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 2.14.6+ds-5+b1 | 1 906,2 кБ | 20 531,0 кБ | [списък на файловете] |