[ bianca ]
[ aria ]
[ Kaynak: ariba ]
Paket: ariba (2.14.6+ds-5 ve diğerleri)
ariba için bağlantılar
ariba Kaynak Paketini İndir:
Geliştiriciler:
Dış Kaynaklar:
- Ana Sayfa [github.com]
Benzer paketler:
Antibiotic Resistance Identification By Assembly
ARIBA is a tool that identifies antibiotic resistance genes by running local assemblies. The input is a FASTA file of reference genes and paired sequencing reads. ARIBA reports which of the reference genes were found, plus detailed information on the quality of the assemblies and any variants between the sequencing reads and the reference genes.
ariba ile İlgili Diğer Paketler
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: fastaq
- Paket mevcut değil
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
-
- dep: libfml0 (>= 0.1)
- Paket mevcut değil
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC support library
-
- dep: libminimap0 (>= 0.2)
- Paket mevcut değil
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: mash
- Paket mevcut değil
-
- dep: mummer
- Paket mevcut değil
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-biopython
- Paket mevcut değil
-
- dep: python3-bs4
- error-tolerant HTML parser for Python 3
-
- dep: python3-dendropy
- Paket mevcut değil
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-pymummer
- Paket mevcut değil
-
- dep: python3-pysam
- Paket mevcut değil
-
- dep: python3-tk
- Tkinter - Writing Tk applications with Python 3.x
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- sug: spades
- Paket mevcut değil
ariba indir
| Mimari | Sürüm | Paket Boyutu | Kurulu Boyut | Dosyalar |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.14.6+ds-5+b1 | 1.909,9 kB | 20.451,0 kB | [dosya listesi] |
| arm64 | 2.14.6+ds-5+b1 | 1.906,2 kB | 20.531,0 kB | [dosya listesi] |